健康分为生理上的健康和精神上的健康。
在身体方面，由于垂直城市生活的环境完全可控，并针对人的生活需要进行优化，外界对人体的各种不良刺激减少，如高温、低温、潮湿、干燥、风寒、紫外线照射、环境污染等。这些刺激因素，对人们的健康一般都是有害的，引起不适或疾病如中暑、脱水、感冒、风湿、皮肤疾病、季节性流行病等。空气污染引起很多呼吸系统慢性病。
垂直城市优化的生活环境，纯净的空气，可以大幅降低各种疾病的发生率，改善生活质量。
在季节变换时，人们容易生病。因为身体需要随环境变化而调整，体弱或者敏感的人难免会生病。
阳光中部分紫外线是有害的，能够让皮肤加速老化，并引发皮肤癌。现代人看起来比农业时代的人年轻，除了营养改进，生活条件改善，更少晒太阳也是一个重要原因。人体只需要很少的紫外线，就可以由皮肤合成身体需要的维生素D，可以在人工照明中加入这部分有用的紫外线解决。
垂直城市还可以全面监控空气质量和病原体数量，阻断传染病的传播渠道。随时监控发热病人，保证病人得到及时的治疗。这些措施可以大大减少全体市民生病的机会。
精神层面的疾病比较复杂，除了先天因素外，很多疾病包括亚健康等，和人们受到的各种压力有关。现代社会的各种问题，如住房、养老、看病、社会保障、甚至堵车都会引起各种各样的焦虑。缺乏交流也是心理不健康的诱因。垂直城市可以消除目前社会的很多焦虑来源，大家可以花更多的时间在家庭中，可以有更多的人际交流，这些都有助于心理健康。交流对老人、儿童以及一些心理脆弱的人尤其重要。家庭生活，人际交流的增加可以大大改善这些人群的生活质量，提高幸福感。
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